Идентификация SNP, ассоциированных с воспроизводительной способностью крупного рогатого скота

Быкова Ольга Александровна; Костюнина Ольга Васильевна; Степанов Алексей Владимирович; Шевкунов Олег Александрович

doi:10.32417/1997-4868-2023-235-06-53-66

ВАК 4.2.4

ИДЕНТИФИКАЦИЯ SNP, АССОЦИИРОВАННЫХ С ВОСПРОИЗВОДИТЕЛЬНОЙ СПОСОБНОСТЬЮ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА Идентификация SNP, ассоциированных с воспроизводительной способностью крупного рогатого скота

АА Аа

Опубликовано в Аграрный вестник Урала · Том 235, Номер 06 · Страницы 53–66 · Рубрика: Биология

DOI: https://doi.org/10.32417/1997-4868-2023-235-06-53-66

Получено: 05.07.2023 Одобрено: 05.07.2023 Опубликовано: 05.07.2023

Авторы

БЫ

Быкова Ольга Александровна

КО

Костюнина Ольга Васильевна

СТ

Степанов Алексей Владимирович

ШЕ

Шевкунов Олег Александрович

ORCID

БЫ

Быкова Ольга Александровна

Ученая степень: доктор сельскохозяйственных наук

Ученое звание: профессор

Уральский государственный аграрный университет профессор · кафедры Технологии производства и переработки сельскохозяйственной продукции · Россия

КО

Костюнина Ольга Васильевна

Ученая степень: доктор биологических наук

Всероссийский институт животноводства им. Л. К. Эрнста Россия

Уральский государственный аграрный университет Россия

СТ

Степанов Алексей Владимирович

Ученая степень: кандидат сельскохозяйственных наук

Уральский государственный аграрный университет доцент · Россия

ШЕ

Шевкунов Олег Александрович

Уральский государственный аграрный университет специалист по научно-технической информации · Международный научно-образовательный и маркетинговый центр · Екатеринбург

ORCID

АННОТАЦИЯ

Аннотация. Проблема воспроизводства крупного рогатого скота в Российской Федерации из года в год остается актуальной и характеризуется достаточно низким выходом приплода в расчете на 100 маток, что приносит значительный экономический ущерб. Решение этой проблемы связано с увеличением эффективности реализации генетически детерминированных репродуктивных возможностей животных. Поиск генетических изменений, являющихся причинами снижения репродуктивных способностей сельскохозяйственных животных, и выявление причин летальности имеет фундаментальное значение для эффективного развития животноводства. Полногеномное сканирование с помощью чипов позволяет идентифицировать геномные регионы, мутации в которых приводят к возникновению экономически-значимых проблем, таких как эмбриональная смертность, генетические аномалии, нарушения развития, что характеризуется научной и практической значимостью. Научная новизна заключается в изучении молекулярно-генетических механизмов контроля фертильности крупного рогатого скота. Цель работы – выявление аллельных вариантов SNP, ассоциированных с воспроизводительной способностью крупного рогатого скота. Проведено полногеномное генотипирование. Методы исследований. Исследования проведены на коровах голштинизированной черно-пестрой породы уральского типа. Изучен генетический профиль животных черно-пестрой породы, идентифицированы SNP, значимо ассоциированные с воспроизводительными качествами коров, определены генетические варианты и сочетания по ДНК-маркерам, обуславливающие улучшение воспроизводительных качеств коров. Результаты. По показателям воспроизводства (кратность осеменения, продолжительность сервис периода) установлено, что кратность осеменения для животных с генотипом ARS-BFGL-NGS-71623GG составила 1,33, что ниже по сравнению с генотипами ARS-BFGL-NGS-71623АА и ARS-BFGL-NGS-71623АG на 0,27 и 0,5 единиц. Телок с генотипом ARS-BFGL-NGS-85003AC осеменяют в более раннем возрасте, чем остальных животных. Достоверная разница по живой массе при первом осеменении отмечена только по SNP ARS-BFGL-NGS-71623. Рекомендуем для улучшения воспроизводительной способности коров в племенное ядро отбирать животных с гомозиготным генотипом ARS-BFGL-NGS-71623GG.

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА

крупный рогатый скот, полногеномное генотипирование, воспроизводительная способность, ДНК-маркеры

Текст

Текст (PDF)

Читать Скачать

1. Гетманцева Л. В., Шевцова В. С., Колосова М. А., Романенкова О. С., Костюнина О. В. Исследование гаплотипов фертильности у голштинских коров голландского происхождения в условиях ростовской области // Главный зоотехник. 2020. № 4. С. 36-40. DOI: https://doi.org/10.33920/sel-03-2004-05; EDN: https://elibrary.ru/EFDGGS

2. Форнара М. С., Костюнина О. В., Филипченко А. А., Сермягин А. А., Зиновьева Н. А. Система определения полиморфизма SUGT1, ассоциированного с гаплотипом фертильности симментальского скота FH4 // Ветеринария, зоотехния и биотехнология. 2019. № 3. С. 92-97. DOI:https://doi.org/10.26155/vet.zoo.bio.201903015. EDN: https://elibrary.ru/XZZVOQ

3. Исупова Ю. В., Ачкасова Е В. Перспективы использования оценки геномной племенной ценности в селекции молочного скота в условиях Удмуртской Республики // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2021. № 4 (90). С. 307-311. EDN: https://elibrary.ru/YYBQKA

4. Нарышкина Е. Н., Сермягин А. А. Оценка генетической и геномной вариабельности признаков фертильности быков-производителей на основе локусов в геноме, ассоциированных с давлением отбора (обзор) // Достижения науки и техники АПК. 2020. № 9. С. 64-72. DOI: https://doi.org/10.24411/0235-2451-2020-10912; EDN: https://elibrary.ru/YLVVNZ

5. Романенкова О. С., Волкова В. В., Костюнина О. В., Зиновьева Н. А. Исследование Российской популяции голштинского и голштинизированного черно-пестрого купного рогатого скота на наличие мутации в гене TFB1M, ассоциированного с гаплотипом HH5 // Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и сельскохозяйственной микробиологии: сборник тезисов докладов 19-й Всероссийской конференции молодых ученых, посвященной памяти академика РАСХН Георгия Сергеевича Муромцева. Москва, 2019. С. 119-120. EDN: https://elibrary.ru/NABUTM

6. Кузнецова М. К., Кислякова Е. М., Исупова Ю. В. Достоверность учёта данных как один из способов повышения точности при оценке племенной ценности // Аграрная Россия. 2022. № 1. С. 27-30. DOI: https://doi.org/10.30906/1999-5636-2022-1-27-30; EDN: https://elibrary.ru/RHNEQG

7. Лукьянов А. А., Тюлебаев С. Д., Косилов В. И. Использование возможностей геномной оценки крупного рогатого скота в РФ // Актуальные проблемы ветеринарной медицины и зоотехнии: сборник материалов Национальной научно-практической конференции с международным участием, посвященной 80-летию доктора сельскохозяйственных наук, профессора кафедры ветеринарно-санитарной экспертизы и фармакологии ФГБОУ ВО Оренбургский ГАУ Ляпина Олега Абдулхаковича. Оренбург, 2022. С. 132-137. EDN: https://elibrary.ru/LRLHQM

8. Абдельманова А. С., Сермягин А. А., Доцев А. В., Родионов А. Н., Столповский Ю. А., Зиновьева Н. А. Полногеномные исследования структуры популяций российских локальных пород черно-пестрого корня // Генетика. 2022. Т. 58. № 7. С. 786-797. DOI:https://doi.org/10.31857/S0016675822070025. EDN: https://elibrary.ru/EDWHHP

9. Ганиев А. С., Сибагатуллин Ф. С., Шайдуллин Р. Р., Фаизов Т. Х. Сервис-период и молочная продуктивность коров с разными генотипами CSN3 и DGAT1 // Ученые записки КГАВМ им. Н. Э. Баумана. 2018. № 2. С. 67-72. EDN: https://elibrary.ru/UROZPD

10. Иванова И. П., Троценко И. В. Применение селекционно-генетических параметров в племенной работе с молочным скотом // Вестник КрасГАУ. 2019. № 3 (144). С. 65-70. EDN: https://elibrary.ru/ZABDED

11. Яковлев А. Ф. Вклад гаплотипов в формирование племенных и воспроизводительных качеств животных (обзор) // Проблемы биологии продуктивных животных. 2019. № 2. С. 5-18. DOI:https://doi.org/10.25687/1996-6733.prodanimbiol.2019.2.5-18. EDN: https://elibrary.ru/CDSADL

12. Guarini A. R., Lourenco D. A. L., Brito L. F., Sargolzaei M., Baes C. F., Miglior F., Misztal I., Schenkel F. S. Genetics and genomics of reproductive disorders in Canadian Holstein cattle // Journal of Dairy Science. 2019. No. 102. Iss. 2. Рp. 1341-1353. DOI:https://doi.org/10.3168/jds.2018-15038.

13. Garcia A. O., Otto P. I., Glatzl Junior L. A., Rocha R. F. B., Dos Santos M. G., de Oliveira D. A., da Silva M. V. G. B., Panetto J. C. D. C., Machado M. A., Verneque R. D. S., Guimarães S. E. F. Pedigree reconstruction and population structure using SNP markers in Gir cattle // Journal of Applied Genetics. 2023. No. 64 (2). Pp. 329-340. DOI:https://doi.org/10.1007/s13353-023-00747-x. EDN: https://elibrary.ru/XWDKTT

14. Ma L., Cole J. B., Da Y., VanRaden P. M. Genetics, genome-wide association study, and genetic improvement of dairy fertility traits // Journal of Dairy Science. 2019. Vol. 102. Iss. 4. Рp. 3735-3743. DOIhttps://doi.org/10.3168/jds.2018-15269.

15. Huang M., Liu X., Zhou Y., Summers R. M., Zhang Z. BLINK: a package for the next level of genome-wide association studies with both individuals and markers in the millions // Gigascience. 2019. No. 8 (2). Article number giy154. DOI:https://doi.org/10.1093/gigascience/giy154. EDN: https://elibrary.ru/WYGWIP

16. Pausch H., Schwarzenbacher H., Burgstaller J., Flisikowski K., Wurmser K., Jansen S., Jung S., Schnicke A., Wittek T., Rudy K. Homozygous haplotype deficiency reveals deleterious mutations compromising reproductive and rearing success in cattle // BMC Genomics. 2015. No. 16 (1). Article number 312. DOI:https://doi.org/10.1186/S12864-015-1483-7. EDN: https://elibrary.ru/UTYWKT

17. Wang J., Zhou Z., Zhang Z., Li H., Liu D., Zhang Q., Bradbury P. J., Buckler E. S., Zhang Z. Expanding the BLUP alphabet for genomic prediction adaptable to the genetic architectures of complex traits // Heredity. 2018. Vol. 121 (6). Pp. 648-662. DOI:https://doi.org/10.1038/s41437-018-0075-0. EDN: https://elibrary.ru/SHIRWC

18. Sahana G., Nielsen U. S., Aamand G. P., Lund M. S., Guldbrandtsen B. Novel Harmful Recessive Haplotypes Identified for Fertility Traits in Nordic Holstein Cattle // PLoS ONE. 2013. Vol. 8. Iss. 12. Article number 82909. DOI:https://doi.org/10.1371/journal.pone.0082909.

19. Sugimoto M., Gotoh Y., Kawahara T., Sugimoto Y. Molecular Effects of Polymorphism in the 3’UTR of Unc-5 homolog C Associated with Conception Rate in Holsteins // PLoS ONE. 2015. Vol. 10. Iss. 7. Article number 0131283. DOI:https://doi.org/10.1371/journal.pone.0131283.

20. VanRaden M., Olson K. M., Null D. J., Hutchison J. L. Harmful recessive effects on fertility detected by absence of homozygous haplotypes // Journal of Dairy Science. 2011. Vol. 94. Iss. 12. Рp. 6153-6161. DOI:https://doi.org/10.3168/JDS.2011-4624.

PDF Текст JATS XML

Главный редактор, председатель редколлегии

2951

загрузка

ГОСТ

Быкова О. А., Костюнина О., Степанов А. В., Шевкунов О. А. Идентификация SNP, ассоциированных с воспроизводительной способностью крупного рогатого скота // Аграрный вестник Урала. 2023. №. 06. С. 53-66. DOI: https://doi.org/10.32417/1997-4868-2023-235-06-53-66. (дата обращения: 22.09.2026).

MLA

Быкова Ольга Александровна, Костюнина О., Степанов А. В., Шевкунов О. А.. "Идентификация SNP, ассоциированных с воспроизводительной способностью крупного рогатого скота." Аграрный вестник Урала 235.06 (2023): 53-66. DOI: https://doi.org/10.32417/1997-4868-2023-235-06-53-66.

APA

Быкова О. А., Костюнина О., Степанов А. В., Шевкунов О. А. (2023). Идентификация SNP, ассоциированных с воспроизводительной способностью крупного рогатого скота. Аграрный вестник Урала, 235(06), 53-66. https://doi.org/10.32417/1997-4868-2023-235-06-53-66

Chicago

Быкова Ольга Александровна, Костюнина О., Степанов А. В., Шевкунов О. А.. "Идентификация SNP, ассоциированных с воспроизводительной способностью крупного рогатого скота." Аграрный вестник Урала 235, no. 06 (2023): 53-66. https://doi.org/10.32417/1997-4868-2023-235-06-53-66.

WIKI

{{cite journal | author = Быкова О. А., Костюнина О., Степанов А. В., Шевкунов О. А. | title = Идентификация SNP, ассоциированных с воспроизводительной способностью крупного рогатого скота | journal = Аграрный вестник Урала | year = 2023 | volume = 235 | issue = 06 | pages = 53-66 | doi = 10.32417/1997-4868-2023-235-06-53-66 }}

Скопировать

Экспорт: BibTeX EndNote RefMan RusMARC

Подтверждение