Россия
Россия
Аннотация. Цель исследований – провести анализ оценки влияния коэффициента инбридинга, рассчитанного по формуле Райта – Кисловского, и уровня гомозиготности по STR-маркерам на показатели оценки племенной ценности по линейной оценке экстерьера. Методы исследований. Объектом исследования служили дочери (n = 42245) 355 быков-производителей черно-пестрого и голштинского скота Московской области. Расчет производился с учетом не менее 10 дочерей на быка-производителя. Весь массив данных для EBV составил 42 076 голов крупного рогатого скота для 318 быков-отцов и был разделен на четыре группы относительно Fx: в первую входили аутбредные животные (0 %), во вторую – с Fx = 0…3,125, в третью – с Fx = 3,126…6,25, в четвертую – с Fx ≥ 6,25, в пятую – все животные, кроме аутбредных. Для расчета по STR общая выборка составила 306 быков-производителей для 39 590 дочерей. Так, в первую группу вошли гетерозиготные особи Ca = 0 %, во вторую – особи с Ca = 8…50 %, в третью – с Cа = 55…77 %, группу сравнения составляли особи, имеющие Са = 8…77 %, что в среднем по выборке 28,74 %. Результаты. Отмечено отсутствие достоверной разности между исследуемыми группами животных по «классическому» расчету посредством градации коэффициента инбридинга, за исключением глубины туловища от –0,039 до 0,141, угла задних ног сбоку от –0,073 до 0,073, длины сосков от –0,064 до 0,096, крепости от –0,02 до 0,076 и молочного типа от –0,018 до 0,222 (р ˂ 0,05 – р ˂ 0,001) по системе оценки «Б». Результаты расчетов по STR-маркерам имели схожие зависимости: угол задних ног вид сбоку от –0,055 в первой группе до 0,109 в третьей, расположение передних сосков от –0,129 до 0,179. Коэффициент регрессии увеличивался наряду с минимальным количеством дочерей по показателям угол задних ног сбоку, высота задних долей и глубина вымени. Научная новизна заключается в том, что впервые в России будет исследовано влияние оценки племенной ценности по линейной оценке экстерьера в зависимости от коэффициента инбридинга и уровня гомозиготности, рассчитанного по STR-маркерам.
черно-пестрый скот, голштинский скот, оценка типа телосложения, гомозиготность, оценка племенной ценности, стати экстерьера, инбридинг, микросателлиты, FХ, EBV, ОТТ, КРС, STR
1. Yengo L., Zhu Z., Wray N. R., Weir B. S., Yang J., Robinson M. R., Visscher P. M. Detection and quantification of inbreeding depression for complex traits from SNP data // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2017. Vol. 114. Pp. 8602-8607.
2. Caballero A., Villanueva B., Druet T. On the estimation of inbreeding depression using different measures of inbreeding from molecular markers // Evolutionary Applications 2021. Vol. 14. Pp. 416-428.
3. Kardos M., Nietlisbach P., Hedrick P.W. How should we compare different genomic estimates of the strength of inbreeding depression? // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2018. Vol. 115. Pp. 2492-2493.
4. Недашковский И. С., Сермягин А. А., Богданова Т. В., Ермилов А. Н., Янчуков И. Н., Зиновьева Н. А. Оценка влияния уровня инбридинга на молочную продуктивность и воспроизводительные качества коров голштинизированной популяции черно-пестрой породы // Молочное и мясное скотоводство. 2018. № 7. С. 17-22.
5. Недашковский И. С., Костюнина О. В., Волкова В. В., Ермилов А. Н., Сермягин А. А. Оценка племенной ценности быков-производителей голштинской породы по качеству потомства в связи с уровнем гомозиготности по STR-маркерам [Электронный ресурс] // Вестник Рязанского государственного агротехнологического университета им. П. А. Костычева. 2019. № 3 (43). С. 36-43. DOI:https://doi.org/10.36508/RSATU.2019.43.41328. URL: http://vestnik.rgatu.ru/archive/2019_3.pdf#page=36 (дата обращения: 20.09.2022).
6. Сидорова В. Ю., Попов Н. А. Особенности признаков телосложения, связанных с воспроизводством у дочерей инбредных и аутбредных быков // Молочное и мясное скотоводство. 2017. № 2. С. 15-17.
7. Doekes H. P., Veerkamp R. F., Bijma P., de Jong G., Hiemstra S. J., Windig J. J. Inbreeding depression due to recent and ancient inbreeding in Dutch Holstein-Friesian dairy cattle // Genetics Selection Evolution. 2019. Vol. 51. Pp. 1-16
8. Makanjuola B. O., Maltecca C., Miglior F., Schenkel F. S., Baes C. F. Effect of recent and ancient inbreeding on production and fertility traits in Canadian Holsteins // BMC Genomics. 2020. Vol. 21 Article number: 605. URL: https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-020-07031-w (date of reference: 12.11.2022).
9. Han W., Xue Q., Li G., Yin J., Zhang H., Zhu Y., Xing W., Cao Y., Su Y., Wang K. Genome-wide analysis of the role of DNA methylation in inbreeding depression of reproduction in Langshan chicken // Genomics. 2020. Vol. 112. Pp. 2677-2687.
10. Doekes H. P., Bijma P., Windig J. J. How Depressing Is Inbreeding? A Meta-Analysis of 30 Years of Research on the Effects of Inbreeding in Livestock // Genes. 2021. Vol. 12. Article number. 926. DOI:https://doi.org/10.3390/genes12060926.
11. Ерохин, А. И., Солдатов А. П., Филатов А. И. Инбридинг и селекция животных. Москва: Агропромиздат, 1985. 155 с.
12. Peakall R., Smouse P. E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and researchan update // Bioinformatics. 2012. Vol. 28. Pp. 2537-2539.
13. Савенко Н. А. Селекционер Подмосковья. Москва: МСХиП МО, 2006. 84 с.
14. Misztal I., Tsruta S., Strabel T. et. al. BLUPF90 and related programs (BGF90) // Proceedings of the 7th world congress on genetics applied to livestock production. Montpellier, 2002. Vol. 28 (27). Pp. 21-22.
15. Недашковский И. С., Сермягин А. А., Костюнина О. В., Волкова В. В., Гладырь Е. А., Янчуков И. Н. Популяционно-генетическая характеристика, оценка геномного инбридинга и гомозиготности крупного рогатого скота черно-пестрой и голштинской пород по STR и SNP маркерам в России // Вестник Пермского Университета. Серия: Биология. 2021. № 4. С. 295-306. DOI:https://doi.org/10.17072/1994-9952-2021-4-295-306.
16. Контэ А. Ф., Недашковский И. С., Ермилов А. Н., Сермягин А. А. Влияние уровня инбридинга быков-производителей на показатели типа телосложения их дочерей // Молочное и мясное скотоводство. 2022. № 4. С. 19-25. DOI:https://doi.org/10.33943/MMS.2022.26.83.003.
17. Howard J. T., Pryce J. E., Baes C., Maltecca C. Invited review: Inbreeding in the genomics era: Inbreeding, inbreeding depression, and management of genomic variability // Journal of Dairy Science. 2017. Vol. 100. Pp. 6009-6024.
18. Baes C. F., Makanjuola B. O., Miglior F., Marras G., Howard J. T., Fleming A., Maltecca C. Symposium review: The genomic architecture of inbreeding: How homozygosity affects health and performance // Journal of Dairy Science. 2019. Vol. 102. Pp. 2807-2817.
19. Maltecca C., Tiezzi F., Cole J. B., Baes C. Symposium review: Exploiting homozygosity in the era of genomics - Selection, inbreeding, and mating programs // Journal of Dairy Science. 2020. Vol. 103. Pp. 5302-5313.
20. Martikainen K., Koivula M., Uimari P. Identification of runs of homozygosity affecting female fertility and milk production traits in Finnish Ayrshire cattle // Scientific Reports. 2020. Vol. 10. Article number: 3804. URL: https://www.nature.com/articles/s41598-020-60830-9?error=cookies_not_supported&code=cee74166-3ad8-4504-921d-cfae4e469a23 (date of reference: 12.11.2022).
